Einstellungen -> Erweitert -> Konfiguration bearbeiten (Button unten im Fenster)

Dort suchen nach:

network.protocol-handler.warn-external.http
und
network.protocol-handler.warn-external.https

Beide durch Doppelklicken auf true stellen. Dann fragt Thunderbird beim nächsten mal nach dem Browser mit dem geöffnet werden soll.

…thanks to askubuntu.com